بدأت مسيرة ضمان الجودة في جامعة البترا عام 2006 عندما شاركت جامعة البترا في جميع الأنشطة وورش العمل التي نظمها صندوق الحسين للتميز (HFE). بعد ذلك، شاركت جميع إدارات جامعة البترا في برنامج تدقيق HFE، وتم إطلاق مشروع نظام إدارة الجودة (QMS - ISO 9001:2008) في عام 2010. حصلت جامعة البترا رسميًا على شهادة ISO 9001 عند الانتهاء من التدقيق الخارجي من قبل المؤسسة المانحة في عام 2011. واستمرت عملية التطوير حتى حصول الجامعة على شهادة (QMS - ISO 9001:2015) عام 2017، وتستمر رحلة التحسين والتطوير وتحقيق النجاح.